Инновационное развитие вузовского сектора науки можно рассматривать как мини-модель, характеризующую нововведения в вузе. Рассматривая процедуру инновации в научном секторе, следует перманентно вносить изменения в перечень показателей, характеризующих объем и структуру научных исследований, в модели и методы их расчета, а также критерий их эффективности. Изменения, вносимые в структурные подразделения, как правило, сталкиваются с нежеланием сотрудников менять традиционные методы соподчинения, координации и форм обмена информацией. Негативные моменты усиливают значимость проведения маркетинговых коммуникаций в области создания благоприятных условий при внедрении инновационных изменений. Отдел НИР, разрабатывающий стратегическую концепцию маркетинга вузовской науки, сталкивается со многими проблемами при формировании структуры организационных нововведений. В первую очередь следует определить, на что ориентируется администрация вуза при постановке задачи вузовской инновации научной деятельности. В обобщенном виде могут быть представлены два варианта действий. Первый вариант берет за основу уже существующую структуру вуза. Инновационные действия ориентируются на имеющуюся структуру, и происходит лишь модернизация методов работы. Второй вариант предполагает ориентацию на будущую структуру вуза, при условии, что последняя будет существенно меняться. Данная стратегия маркетинга предполагает разработку новой концепции развития вузовской науки, максимальное развитие маркетинговых коммуникаций, построение новых систем организационных взаимодействий. Перспективность рассматриваемой стратегии должна определяться сокращением времени и объема прохождения информации по структурным подразделениям вузовской науки, достижением скоординированности принимаемых решений, повышения профессионализма работников по анализу и обработке инновационной деятельности. Занимая в концепции стратегического маркетинга вузовской науки центральное место, инновационное развитие науки может быть представлено теоретической основой, позволяющей определять, учитывать и проводить анализ всех ресурсов, формирующих базу научных исследований, коллективы непосредственных создателей научной продукции, а также потенциальных потребителей результатов НИР как во внутренней, так и во внешней среде. В статье на рисунках представлены – схема инновационного развития вузовской науки и схема управления функционированием вузовской науки.