В ускорении научно-технического прогресса в стране при переходе к рыночной экономике решающее влияние может оказать деятельность инновационных структур, осуществляющих комплекс работ, связанных с созданием и освоением в производстве нововведений в области техники. При увеличении масштабов деятельности инновационной сферы, повышении сложности осуществляемых в ней работ по созданию наукоемкой продукции, расширении инфраструктуры услуг, оказываемых сферой поддержки, в число первостепенных задач выдвигается необходимость повышения результативности инновационной деятельности. Разнообразие сложившихся в практике организационных форм инновационной деятельности не исключает высокую степень общности целей, задач и условий их деятельности. Это позволяет определить у субъектов инновационной деятельности общие черты и правила экономического анализа их научно-технической деятельности. Отмеченное в статье позволяет сформулировать концептуальный подход к разработке методологии оценки и экономического анализа вузовского инновационного процесса в следующем виде: 1) разработка единого понятийного аппарата, характеризующего инновационную деятельность; 2) создание классификатора стадий и этапов инновационного процесса; 3) методика оценки и экономического анализа результатов инновационного процесса как комплексного подхода экономической оценки результатов всех стадий, составляющих инновационный процесс с учетом логистической последовательности анализа его проведения; 4) методическое обеспечение системы оценки и экономического анализа результатов инновационного процесса должно включать в себя создание методических материалов, регламентирующих состав показателей, используемых для оценки методов их расчета; 5) информационное обеспечение работы по оценке и экономическому анализу результатов инновационной деятельности должно базироваться на создании информационных массивов, учетно-отчетной первичной документации для накопления банков данных и получения на их основе сводных оценок: 6) организационное обеспечение системы оценки и экономического анализа результатов инновационного процесса должно создать четко действующий порядок проведения оценки результатов инновационной деятельности, установления периодичности и сроков ее проведения. Разработка подобной методологии оценки и экономического анализа результатов инновационной деятельности – назревшая проблема и ее решение требует проведения отдельных научных исследований.