Оценка эффективности научно-технической деятельности традиционно является сложным объектом расчетов как с точки зрения выработки определенной системы критериев и показателей, отражающих эффективность производственных затрат, так и с точки зрения выбора базы сравнения. Для оценки эффективности управления, в том числе и государственной собственностью, в последнее время активно используется концепция управления стоимостью предприятия. Концепция управления стоимостью рассматривает эффективность управления в стратегическом аспекте, а не в категориях текущих показателей ликвидности, рентабельности, прибыли. Рассматривая теоретические аспекты концепции управления стоимостью применительно к научно-технической сфере, необходимо отметить, что показатели увеличения стоимости наиболее адекватно отражают специфику научно-технической сферы как объекта управления, поскольку позволяют учитывать не только материальную составляющую стоимости организации научно-технической сферы, но и накопленные знания, квалификацию персонала, научные традиции и другие элементы интеллектуальной составляющей собственности. Кроме того, концепция управления стоимостью предполагает необходимость повышения стоимости компании, которая в свою очередь связана с использованием результатов инновационных проектов. Концепция управления стоимостью предприятия ориентирует менеджмент на рост рыночной стоимости организации или рост стоимости имущественного комплекса, создаваемого либо развиваемого в инновационных проектах. Эта концепция, в противоположность концепции максимизации текущих и ожидаемых в ближайшее время прибылей, предполагает перенос акцента на реализацию инновационных проектов, обеспечивающих достижение инновационной монополии и позволяющих достичь стабильных и повышенных по отношению к ближайшим конкурентам денежных потоков. Концепция управления стоимостью позволяет расширить рамки оценки эффективности деятельности органов управления в научно-технической сфере и обеспечивает возможность комплексной оценки результатов научно-технической деятельности с учетом особенностей создаваемого в научно-технической сфере продукта. Управление стоимостью предполагает выделение структурных элементов имущественного комплекса организации и оценку их полезности в стоимостной форме. Стоимостной подход к оценке деятельности организаций научно-технической сферы, с одной стороны, может стать важным и объективным инструментом при проведении инвентаризации государственного сектора науки, при оптимизации структуры государственной собственности в научно-технической сфере. С другой стороны, оценочная деятельность должна стать основой при формировании системы контрактных отношений между государством и организациями научно-технической сферы, деятельность которых относится к конкурентному сектору экономики. Концепция управления стоимостью в научно-технической сфере предполагает выявление неэффективно управляемых и используемых объектов государственной собственности. В интересах государства рассматривать повышение ценности государственной собственности не только как единовременного источника получения дохода от ее продажи, но и создание долговременного и перспективного источникам пополнения средств федерального бюджета за счет эффективного использования собственности, в частности, ее интеллектуальной составляющей.